Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASIC1P78348 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms