Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF6P49848 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms