Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms