Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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