Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms