Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms