Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms