Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms