Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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