Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHBP21953 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms