Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NELFEP18615 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NELFEP18615 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NELFEP18615 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NELFEP18615 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NELFEP18615 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NELFEP18615 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NELFEP18615 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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