Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF4P15884 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF4P15884 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms