Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTN1P12814 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms