Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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