Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ESRRAP11474 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.1 ms