Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF1P10914 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF1P10914 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF1P10914 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF1P10914 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms