Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC192P0DO97 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms