Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTBP09497 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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