Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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