Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms