Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms