Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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