Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms