Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms