Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXP3Q9BZS1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXP3Q9BZS1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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