Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCD2Q9BXW9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms