Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2BQ99453 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms