Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGF29Q96ES7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGF29Q96ES7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGF29Q96ES7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGF29Q96ES7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGF29Q96ES7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGF29Q96ES7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SGF29Q96ES7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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