Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPBP1Q92547 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms