Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMIEQ8NEW7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms