Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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