Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 476 ms