Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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