Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms