Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms