Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms