Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP350Q5VT06 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms