Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms