Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC38Q502W7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms