Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms