Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms