Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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RTL8BQ17RB0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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RTL8BQ17RB0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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RTL8BQ17RB0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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RTL8BQ17RB0 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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