Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PTPRNQ16849 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRNQ16849 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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