Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SGCAQ16586 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCAQ16586 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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