Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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