Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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