Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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