Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SS18Q15532 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SS18Q15532 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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