Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms