Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PUM3Q15397 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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PUM3Q15397 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PUM3Q15397 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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PUM3Q15397 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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PUM3Q15397 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PUM3Q15397 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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